Het Nationaal Jongenskoor is een onderdeel van de Nationale Koren, bedoeld voor kinderen en jongeren om op hoog niveau in koorverband te kunnen zingen. Het Jongenskoor onder leiding van Irene Verburg staat open voor jongens vanaf negen jaar tot aan hun stembreuk. Naast wekelijkse lessen is er elke drie weken een repetitiedag om concerten voor te bereiden. Het koor werkt samen met diverse grote orkesten in Nederland, waaronder het Radio Filharmonisch Orkest, het Rotterdams Philharmonisch Orkest en het Koninklijk Concertgebouworkest. In 2019 zong het koor mee met de uitvoering van de Matthäus-Passion door het Nederlands Kamerorkest onder leiding van toenmalig chef-dirigent Marc Albrecht.